Výchozí výstupní formáty pro tištěnou partituru jsou Portable Document Format (PDF) a PostScript (PS). Výstupní formáty Portable Network Graphics (PNG), Scalable Vector Graphics (SVG) a Encapsulated PostScript (EPS) jsou k dispozici prostřednictvím možností příkazového řádku, viz Základní možnosti příkazového řádku pro LilyPond.